Родился 10 апреля 1912 года в г. Вольске Саратовской области. После окончания школы и ФЗУ работал на цементном заводе "Большевик". В 1932 году добровольно поступил в военную школу пилотов. Окончив ее, служил в истребительных частях в Забайкалье.

В мае - сентябре 1939 года в районе реки Халхин-Гол принимал участие в боях с японцами. Постановлением Малого Народного Хурала МНР от 10 августа 1939 года награжден орденом Боевого Красного Знамени 1-й степени.

Звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали "Герой Советского Союза" Василию Петровичу Трубаченко присвоено 29 августа 1939 года за 120 боевых вылетов, 50 воздушных боев, 8 лично сбитых самолетов врага и проявленные при этом доблесть и мужество.

После разгрома японцев у Халхин-Гола В.П. Трубаченко учился в Военно-воздушной академии имени Н.Е. Жуковского. В начале Великий Отечественной войны, получив звание капитана, убыл на фронт и был назначен заместителем командира 182-го истребительного авиационного полка. 

Защищая Одессу, погиб в воздушном бою 16 сентября 1941 года.